ニッピは創業以来、分析室を有していましたが、軍用皮革鞣し(なめし)の研究に際して補助金を得て、1921年(大正10年)に研究棟が建設され、ニッピ研究所として独立しました。その後、商工大臣の認可を受けて、1938年(昭和13年)財団法人日本皮革研究所が併設され、皮革の製造に関する研究、皮革製品の分析、ゼラチンの研究などを行ってきました。
1962年(昭和37年)に研究棟が新築され、ニッピ研究所は次々に新しいテーマに取り組みました。皮・骨の主要タンパク質であるコラーゲンに関する研究は、昭和30年代に始まりました。
それまで不溶性と考えられていたコラーゲンの可溶化に、1960年(昭和35年)に世界に先駆けて成功し、トリプシン・ペプシンによる可溶化法で1963年(昭和38年)に特許を取得しました。
その後も、プロクターゼ(1963年<昭和38年>)やアルカリ(1969年<昭和44年>)によるコラーゲンの可溶化法を次々に開発しました。これらの発見は、それ以後の細胞外マトリックスの基礎研究に非常に重要であるばかりでなく、ソーセージケーシングやコラーゲン化粧品など、ニッピを支える商品の開発に直接結びついています。
また皮革の鞣し(なめし)、写真用ゼラチンの性能向上、ポリ塩化ビニルなどの合成高分子、コラーゲンの基礎および医療への応用、細菌からのコラーゲン分解酵素の分離とその利用など、皮革を中心とした幅広い研究が行われました。